自民國100年1月1日起，每一存款人在國內同一家要保機構之存款本金及利息，合計受到最高保額新臺幣300萬元之保障。要保機構經主管機關或農業金融中央主管機關勒令停業時，存保公司應依下列方式履行保險責任：
- 根據停業要保機構帳冊紀錄及存款人提出之存款餘額證明，將賠付金額以現金、匯款、轉帳或其他撥付方式支付。
- 商洽其他要保機構，對停業要保機構之存款人，設立與賠付金額相等之存款，由其代為支付。
- 對其他要保機構或金融控股公司提供資金、辦理貸款、存款、保證或購買其發行之次順位債券，以促成其併購或承受該停業要保機構全部或部分之營業、資產及負債。
存保公司為加強保護存款人及維護金融秩序，對於停業要保機構如有嚴重危及信用秩序及金融安定之虞者（系統性危機），存保公司理賠時，對存款人之保障得不以最高保額為限。此外，如果停業要保機構未能適時與其他金融機構促成併購，存保公司亦得設立過渡銀行，承受該機構之全部或部分之營業、資產及負債，以維持金融服務不中斷，並儘速促成其被其他金融機構併購。