存保公司成立宗旨為「保障金融機構存款人權益、維護信用秩序、促進金融業務健全發展」，因應國內外金融環境變化，持續推動制度精進與業務功能，以發揮金融安全網角色功能，包含強化承保風險控管、充實保險賠款特別準備金、深化存款保險金融知識、完善要保機構退場處理機制，以及積極投入研究發展及國際合作交流，逐步強化存款保險制度。
為推動及落實環境保護、社會責任及公司治理(ESG)之永續經營，存保公司以「當責治理」、「永續環境」、「普惠金融」及「友善職場」為四大永續發展目標，將永續理念深植於業務運作，鞏固民眾對金融安全的信任。